Veinte autopsias revelan el rol infección secundaria y mortalidad Covid-19

Las infecciones secundarias contribuyen de forma significativa a la mortalidad por Covid-19, pero los factores de microbioma que impulsan esta secuela siguen siendo poco conocidos. Ahora, un estudio realizado por investigadores alemanes y austriacos y publicado por MedRxiv, centrado en las autopsias de 20 pacientes que murieron por covid en la primera ola de la pandemia, han permitido definir y especificar estas infecciones secundarias.

Las autopsias se realizaron de forma completa y en ellas se recogieron varios tipos de muestras para investigaciones basadas en tejidos, medidas moleculares que incluían la secuenciación profunda y la infección del virus.

Gracias a la combinación del cultivo microbiano y la secuenciación profunda de ARN (RNAseq) se puede conocer que el Covid-19 letal se segregó en dos causas principales de muerte, separando los casos con daño alveolar difuso (DAD) dominante o con infecciones secundarias de los pulmones. Los cambios en el microbioma pulmonar fueron profundos con el covid, mostrando una menor biodiversidad y una mayor presencia de patógenos bacterianos en los casos con infecciones secundarias. 

En el estudio, la RNAseq profunda de los tejidos pulmonares reflejó claramente las causas de muerte y la deconvolución celular clasificó los casos de DAD en subgrupos con diferentes composiciones celulares. Las células mieloides, incluidos los macrófagos, y la activación molecular C1q resultaron ser fuertes factores de estratificación que sugieren un vínculo fisiopatológico que posiblemente conduzca a la tolerancia en los subgrupos de DAD.

Microbioma y secuenciación profunda de ARN: claves autopsias covid

Además, en los pulmones que contrajeron Covid-19 se observaron varios signos de deterioro inmunitario, incluida una fuerte inducción de puntos de control inmunitario inhibitorios. De esta manera, el estudio pone de manifiesto profundas alteraciones de la inmunidad local por covid, en las que el deterioro inmunitario conduce a una reducción de la defensa antimicrobiana que favorece el desarrollo de infecciones secundarias además de la infección por SARS-CoV-2.

La investigación conluyó que la patología pulmonar del Covid-19 es multifacética y que un importante factor discriminatorio de los casos letales es la DAD y la presencia de infecciones secundarias. Esto fue evidente por la histología, pero también se reflejó en el análisis transcriptómico profundo y en la microbiología.

Infecciones secundarias: complicación 'extra' para el covid

Las infecciones secundarias se desarrollan hasta en el 42 por ciento de los pacientes con Covid-19. En particular, la DAD causada por el propio virus y las infecciones secundarias son cronológicamente divergentes y provocan reacciones abiertamente diferentes. Cabe destacar que la infección por SARS-CoV-2 por si sola podría no desencadenar un reclutamiento prominente de neutrófilos en el pulmón, y las muestras de neutrófilos encontradas en estudios recientes sobre el covid podrían indicar ya infecciones secundarias.

Por tanto, es importante buscar una preclasificación adecuada de las muestras de tejido basada en la histología para evitar conclusiones erróneas. Además, también hay que señalar que las infecciones pulmonares secundarias son también una complicación en la gripe, el SARS y el MERS.