Inaugurado en 1990, en 1997 fue el primer centro sanitario a nivel estatal en tener un certificado internacional de calidad (ISO 9002) en la cocina, liderado por el propio servicio de este área.
El incremento en la prestación de servicios del hospital hizo que en 2001 se actualizara el área quirúrgica. En 2008 se inauguró la Hospitalización a Domicilio con el objetivo de acortar estancias hospitalarias y disminuir ingresos, y en 2009 se abrió la Unidad de Cirugía Sin Ingreso, u Hospital de Día.
Desde diciembre de 2011 forma parte (junto a cinco unidades de Atención Primaria de la comarca) de la Organización Sanitaria Integrada (OSI) Debabarrena.